Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PbsnO08976 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PbsnO08976 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PbsnO08976 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PbsnO08976 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PbsnO08976 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PbsnO08976 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PbsnO08976 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PbsnO08976 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PbsnO08976 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PbsnO08976 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PbsnO08976 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PbsnO08976 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PbsnO08976 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PbsnO08976 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PbsnO08976 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PbsnO08976 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PbsnO08976 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PbsnO08976 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PbsnO08976 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PbsnO08976 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PbsnO08976 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PbsnO08976 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms