Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CckarO08786 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CckarO08786 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CckarO08786 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CckarO08786 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CckarO08786 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CckarO08786 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CckarO08786 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CckarO08786 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CckarO08786 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CckarO08786 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CckarO08786 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CckarO08786 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CckarO08786 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CckarO08786 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CckarO08786 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CckarO08786 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CckarO08786 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CckarO08786 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CckarO08786 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CckarO08786 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CckarO08786 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CckarO08786 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CckarO08786 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CckarO08786 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CckarO08786 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CckarO08786 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CckarO08786 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CckarO08786 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CckarO08786 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CckarO08786 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CckarO08786 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CckarO08786 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CckarO08786 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CckarO08786 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CckarO08786 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CckarO08786 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CckarO08786 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CckarO08786 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CckarO08786 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CckarO08786 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CckarO08786 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CckarO08786 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CckarO08786 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CckarO08786 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CckarO08786 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CckarO08786 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CckarO08786 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CckarO08786 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CckarO08786 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CckarO08786 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CckarO08786 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CckarO08786 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CckarO08786 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CckarO08786 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CckarO08786 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CckarO08786 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CckarO08786 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CckarO08786 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CckarO08786 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CckarO08786 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CckarO08786 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CckarO08786 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CckarO08786 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CckarO08786 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CckarO08786 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CckarO08786 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CckarO08786 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CckarO08786 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CckarO08786 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CckarO08786 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CckarO08786 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CckarO08786 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CckarO08786 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CckarO08786 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CckarO08786 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CckarO08786 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CckarO08786 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CckarO08786 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CckarO08786 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CckarO08786 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CckarO08786 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CckarO08786 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CckarO08786 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CckarO08786 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CckarO08786 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CckarO08786 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CckarO08786 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CckarO08786 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CckarO08786 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CckarO08786 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CckarO08786 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CckarO08786 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CckarO08786 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CckarO08786 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CckarO08786 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CckarO08786 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CckarO08786 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CckarO08786 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CckarO08786 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms