Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3aO08759 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3aO08759 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ube3aO08759 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms