Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SUPT5HO00267 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
SUPT5HO00267 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SUPT5HO00267 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
SUPT5HO00267 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms