Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD12O00232 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD12O00232 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD12O00232 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms