Protein–RNA interactions for Protein: O00231

PSMD11, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD11O00231 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD11O00231 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMD11O00231 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD11O00231 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms