Protein–RNA interactions for Protein: K9J7G2

Gm8653, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8653K9J7G2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8653K9J7G2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm8653K9J7G2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm8653K9J7G2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm8653K9J7G2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms