Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC024978J3QPC3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC024978J3QPC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms