Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm6176J3QK59 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6176J3QK59 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6176J3QK59 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6176J3QK59 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm6176J3QK59 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm6176J3QK59 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Gm6176J3QK59 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gm6176J3QK59 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm6176J3QK59 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm6176J3QK59 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm6176J3QK59 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm6176J3QK59 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm6176J3QK59 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6176J3QK59 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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