Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21820J3KMU2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21820J3KMU2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21820J3KMU2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21820J3KMU2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21820J3KMU2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21820J3KMU2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm21820J3KMU2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21820J3KMU2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21820J3KMU2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21820J3KMU2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21820J3KMU2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21820J3KMU2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21820J3KMU2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21820J3KMU2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21820J3KMU2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21820J3KMU2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21820J3KMU2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21820J3KMU2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21820J3KMU2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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