Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm20828J3KMI7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20828J3KMI7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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