Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BNX3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BNX3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BNX3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BNX3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BNX3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BNX3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BNX3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BNX3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BNX3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BNX3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BNX3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BNX3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BNX3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BNX3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BNX3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BNX3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BNX3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BNX3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BNX3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BNX3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BNX3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BNX3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BNX3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BNX3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BNX3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BNX3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BNX3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BNX3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BNX3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BNX3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BNX3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BNX3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BNX3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BNX3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BNX3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BNX3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BNX3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BNX3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BNX3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BNX3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BNX3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNX3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNX3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNX3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNX3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNX3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNX3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNX3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNX3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNX3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNX3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNX3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNX3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNX3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNX3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNX3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNX3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BNX3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BNX3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BNX3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BNX3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BNX3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BNX3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BNX3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BNX3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BNX3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BNX3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BNX3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BNX3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNX3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNX3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNX3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNX3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNX3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNX3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNX3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNX3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNX3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNX3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNX3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNX3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNX3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNX3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNX3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNX3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNX3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNX3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNX3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNX3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNX3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNX3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNX3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNX3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNX3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNX3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNX3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNX3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNX3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNX3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms