Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Arfgef1G3X9K3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Arfgef1G3X9K3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Arfgef1G3X9K3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Arfgef1G3X9K3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms