Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nccrp1G3X9C2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nccrp1G3X9C2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms