Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nkx1-1G3UXB3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx1-1G3UXB3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx1-1G3UXB3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx1-1G3UXB3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-1G3UXB3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms