Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ercc6F8VPZ5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
Ercc6F8VPZ5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ercc6F8VPZ5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ercc6F8VPZ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms