Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm3095E9Q058 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3095E9Q058 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3095E9Q058 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3095E9Q058 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms