Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Trappc8E9PWG2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Trappc8E9PWG2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Trappc8E9PWG2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Trappc8E9PWG2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms