Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc13D3YV10 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc13D3YV10 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms