Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930444P10RikD3YUR1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930444P10RikD3YUR1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930444P10RikD3YUR1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms