Protein–RNA interactions for Protein: D3YUJ3

Ccnyl1, Cyclin Y-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnyl1D3YUJ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnyl1D3YUJ3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnyl1D3YUJ3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms