Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf58C9J3I9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf58C9J3I9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms