Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm17333C6EQI3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17333C6EQI3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17333C6EQI3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms