Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nlrc5C3VPR6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrc5C3VPR6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrc5C3VPR6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms