Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
B4DGG1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
B4DGG1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B4DGG1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B4DGG1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B4DGG1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B4DGG1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
B4DGG1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DGG1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DGG1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DGG1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DGG1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DGG1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DGG1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DGG1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DGG1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DGG1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DGG1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B4DGG1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
B4DGG1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
B4DGG1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4DGG1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4DGG1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4DGG1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4DGG1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
B4DGG1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4DGG1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4DGG1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4DGG1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4DGG1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4DGG1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4DGG1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4DGG1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4DGG1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4DGG1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4DGG1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4DGG1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4DGG1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4DGG1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4DGG1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4DGG1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B4DGG1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B4DGG1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
B4DGG1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
B4DGG1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B4DGG1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B4DGG1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B4DGG1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B4DGG1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B4DGG1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B4DGG1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B4DGG1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4DGG1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4DGG1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4DGG1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4DGG1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
B4DGG1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4DGG1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4DGG1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4DGG1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
B4DGG1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
B4DGG1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4DGG1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4DGG1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4DGG1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4DGG1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4DGG1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4DGG1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4DGG1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4DGG1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4DGG1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B4DGG1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B4DGG1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B4DGG1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B4DGG1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B4DGG1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
B4DGG1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B4DGG1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B4DGG1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B4DGG1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
B4DGG1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
B4DGG1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
B4DGG1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B4DGG1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B4DGG1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B4DGG1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
B4DGG1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B4DGG1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B4DGG1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4DGG1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4DGG1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4DGG1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
B4DGG1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
B4DGG1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4DGG1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4DGG1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4DGG1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4DGG1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4DGG1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4DGG1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms