Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Znf518aB2RRF6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Znf518aB2RRF6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Znf518aB2RRF6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Znf518aB2RRF6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Znf518aB2RRF6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Znf518aB2RRF6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Znf518aB2RRF6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Znf518aB2RRF6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Znf518aB2RRF6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Znf518aB2RRF6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms