Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brpf1B2RRD7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Brpf1B2RRD7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Brpf1B2RRD7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms