Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Arhgap42B2RQE8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arhgap42B2RQE8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap42B2RQE8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap42B2RQE8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap42B2RQE8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms