Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Scn7aB1AYL1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Scn7aB1AYL1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Scn7aB1AYL1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scn7aB1AYL1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms