Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nfx1B1AY10 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nfx1B1AY10 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfx1B1AY10 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms