Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NhsB1AV60 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NhsB1AV60 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NhsB1AV60 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NhsB1AV60 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NhsB1AV60 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NhsB1AV60 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NhsB1AV60 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NhsB1AV60 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NhsB1AV60 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NhsB1AV60 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NhsB1AV60 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NhsB1AV60 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NhsB1AV60 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NhsB1AV60 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NhsB1AV60 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NhsB1AV60 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NhsB1AV60 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NhsB1AV60 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NhsB1AV60 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.76■■■■□ 3
NhsB1AV60 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
NhsB1AV60 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
NhsB1AV60 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NhsB1AV60 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NhsB1AV60 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms