Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NOTOA8MTQ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms