Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYSRT1A8MQ03 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYSRT1A8MQ03 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms