Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01549A6NIU2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01549A6NIU2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms