Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAMEF25A6NGN4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF25A6NGN4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF25A6NGN4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF25A6NGN4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms