Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C5orf60A6NFR6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C5orf60A6NFR6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms