Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABD2BA6NFA1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRABD2BA6NFA1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms