Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6CA6NDK9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6CA6NDK9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6CA6NDK9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms