Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWA8A3KMH1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
VWA8A3KMH1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA8A3KMH1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms