Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CtcflA2APF3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CtcflA2APF3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CtcflA2APF3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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