Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Shroom2A2ALU4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Shroom2A2ALU4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Shroom2A2ALU4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Shroom2A2ALU4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Shroom2A2ALU4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Shroom2A2ALU4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Shroom2A2ALU4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Shroom2A2ALU4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Shroom2A2ALU4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Shroom2A2ALU4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Shroom2A2ALU4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Shroom2A2ALU4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Shroom2A2ALU4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Shroom2A2ALU4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Shroom2A2ALU4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Shroom2A2ALU4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Shroom2A2ALU4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Shroom2A2ALU4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Shroom2A2ALU4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Shroom2A2ALU4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Shroom2A2ALU4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Shroom2A2ALU4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Shroom2A2ALU4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Shroom2A2ALU4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms