Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FocadA2AKG8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FocadA2AKG8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FocadA2AKG8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FocadA2AKG8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms