Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd7A2AJK6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chd7A2AJK6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd7A2AJK6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd7A2AJK6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms