Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm27029A2A4P4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm27029A2A4P4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm27029A2A4P4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm27029A2A4P4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms