Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4bA2A432 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4bA2A432 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4bA2A432 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4bA2A432 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4bA2A432 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4bA2A432 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4bA2A432 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4bA2A432 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul4bA2A432 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cul4bA2A432 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cul4bA2A432 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul4bA2A432 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul4bA2A432 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cul4bA2A432 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms