Protein–RNA interactions for Protein: A1L4K1

FSD2, Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSD2A1L4K1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FSD2A1L4K1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FSD2A1L4K1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FSD2A1L4K1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FSD2A1L4K1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FSD2A1L4K1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FSD2A1L4K1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FSD2A1L4K1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FSD2A1L4K1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FSD2A1L4K1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FSD2A1L4K1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FSD2A1L4K1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
FSD2A1L4K1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FSD2A1L4K1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FSD2A1L4K1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FSD2A1L4K1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSD2A1L4K1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms