Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEB3A0JP26 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POTEB3A0JP26 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
POTEB3A0JP26 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POTEB3A0JP26 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POTEB3A0JP26 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POTEB3A0JP26 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms