Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV10-2A0A0K0K1G8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms