Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A087WUJ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087WUJ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087WUJ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms