Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 GSPT1-206ENST00000563468 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.031e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 EIF4B-213ENST00000552490 841 ntTSL 28.44□□□□□ -1.061e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.074e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 EIF4B-209ENST00000550390 871 ntTSL 58.35□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 EIF4B-212ENST00000551527 769 ntTSL 48.21□□□□□ -1.11e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 EIF4B-204ENST00000549077 885 ntTSL 57.8□□□□□ -1.161e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 EIF4B-207ENST00000549645 590 ntTSL 47.8□□□□□ -1.161e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.164e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 CHD6-209ENST00000482596 599 ntTSL 1 (best)6.36□□□□□ -1.391e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 CHD6-204ENST00000440647 536 ntTSL 35.85□□□□□ -1.471e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 NGDN-211ENST00000556699 725 ntTSL 25□□□□□ -1.611e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 GSPT1-209ENST00000567631 678 ntTSL 24.99□□□□□ -1.611e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 TRIM27-204ENST00000467742 541 ntTSL 24.8□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 EIF4B-211ENST00000551002 537 ntTSL 44.43□□□□□ -1.71e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 FUBP3-202ENST00000465949 676 ntTSL 53.84□□□□□ -1.791e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 CCNYL1-204ENST00000420321 602 ntTSL 33.7□□□□□ -1.821e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.393e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 HLA-C-208ENST00000487245 1880 nt24.36■■□□□ 1.493e-17■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 HLA-C-202ENST00000376237 1538 nt22.47■■□□□ 1.193e-17■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.913e-17■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.843e-17■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 HLA-C-205ENST00000466892 754 nt16.11■□□□□ 0.173e-17■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 HLA-C-206ENST00000470363 1279 nt11.41□□□□□ -0.583e-17■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.371e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ALB-215ENST00000510166 532 ntTSL 38.86□□□□□ -0.991e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.251e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 ALB-204ENST00000441319 591 ntTSL 45.99□□□□□ -1.451e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.531e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.571e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 ALB-205ENST00000476441 1604 ntTSL 55.23□□□□□ -1.571e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.571e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.621e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.661e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.691e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 ALB-218ENST00000515133 665 ntTSL 24.44□□□□□ -1.71e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 ALB-217ENST00000514786 577 ntTSL 43.18□□□□□ -1.91e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TDP1-211ENST00000555178 2200 ntTSL 510.46□□□□□ -0.732e-6■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TDP1-202ENST00000393452 2370 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.052e-6■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TDP1-210ENST00000554976 3040 ntTSL 28.45□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TDP1-203ENST00000393454 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.072e-6■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TDP1-204ENST00000545686 2488 ntTSL 1 (best)8.08□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TDP1-214ENST00000556063 1076 ntTSL 1 (best)7.55□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.382e-6■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.099e-9■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.399e-9■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.352e-10■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.299e-9■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 DDX42-212ENST00000581135 589 ntTSL 416.35■□□□□ 0.219e-9■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 HIST1H2AC-201ENST00000314088 1668 ntTSL 1 (best)16.24■□□□□ 0.194e-6■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.174e-6■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.129e-9■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.082e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.084e-6■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-10■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.082e-10■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-10■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-10■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-215ENST00000438141 1743 ntTSL 212.43□□□□□ -0.422e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-202ENST00000383827 4834 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-225ENST00000473661 3811 ntTSL 510.25□□□□□ -0.772e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-221ENST00000455274 2848 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.832e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)18.36■□□□□ 0.537e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.37e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-218ENST00000443148 2031 ntTSL 215.22■□□□□ 0.037e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.317e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-214ENST00000431204 1041 ntTSL 511.67□□□□□ -0.547e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-211ENST00000430390 1674 ntTSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.567e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-201ENST00000310252 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.32□□□□□ -0.67e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-232ENST00000496526 5282 ntTSL 211.01□□□□□ -0.657e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-228ENST00000483051 4176 ntTSL 58.48□□□□□ -1.057e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-220ENST00000452823 579 ntTSL 38.06□□□□□ -1.127e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-18■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.421e-18■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.421e-20■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-206ENST00000419081 591 ntTSL 511.67□□□□□ -0.541e-10■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-208ENST00000426827 756 ntTSL 411.67□□□□□ -0.541e-10■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-231ENST00000496246 507 ntTSL 411.34□□□□□ -0.591e-10■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-204ENST00000417065 565 ntTSL 410.89□□□□□ -0.671e-10■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-207ENST00000422738 545 ntTSL 410.89□□□□□ -0.671e-10■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-222ENST00000459758 555 ntTSL 410.89□□□□□ -0.671e-10■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-226ENST00000474948 603 ntTSL 49.3□□□□□ -0.921e-10■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TTLL3-216ENST00000438596 540 ntTSL 57.3□□□□□ -1.241e-10■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 FAM117A-206ENST00000506156 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.14■■□□□ 1.622e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.452e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 FAM117A-210ENST00000514018 1128 ntTSL 517.52■□□□□ 0.42e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 FAM117A-205ENST00000505159 739 ntTSL 315.09■□□□□ 0.012e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 FAM117A-204ENST00000503855 582 ntTSL 311.79□□□□□ -0.522e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 FAM117A-207ENST00000509347 572 ntTSL 49.91□□□□□ -0.822e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 FAM117A-203ENST00000503720 528 ntTSL 48.49□□□□□ -1.052e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 TCF25-218ENST00000566283 515 ntTSL 218.28■□□□□ 0.525e-7■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.493e-8■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.031e-74■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.021e-74■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 KHSRP-205ENST00000595223 956 ntTSL 517.63■□□□□ 0.411e-74■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 KHSRP-203ENST00000594745 379 ntTSL 314.43□□□□□ -0.11e-74■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 KHSRP-208ENST00000597656 328 ntTSL 58.24□□□□□ -1.091e-74■□□□□ 9.3
ILF3Q12906 ZNF160-214ENST00000601421 4688 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.891e-8■□□□□ 9.2
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